多发性抽动症的鉴别诊断涉及不自主抽动的一些疾病，其中主要是相关基地神经节变性疾病，基地神经节是锥体外系的主要结构，位于大脑半球的深部，包括尾状核、壳核、和苍白球。其中壳核和苍白球称豆状核。由尾状核和壳核组成的新纹状体与维持机体的姿势有关，尾状核的变性即出现舞蹈样动作，壳核的病变与手足徐动、扭转痉挛、舞蹈病有关，苍白球属旧纹状体，与僵硬和姿势反射有关，在临床上，需要与多发性抽动症相鉴别的疾病很多，先将主要的列举如下：
第一节风湿性舞蹈病
风湿性舞蹈病可以出现邹眉、耸额、闭眼、缩颈耸肩等动作，故需与多发性抽动症鉴别，风湿性舞蹈病的发病在与易感儿童经A组β溶血性链球菌感染后产生相应的抗体，这类抗体错误的识别了尾状核的神经原，引起炎症反应而致病。女性多与男性，以四肢和面部为特征的不自主、无目的的快速运动，在兴奋后注意力集中是加剧，入睡后消失，病程为自限性，平均为三个月。舞蹈病可单独存在，但不会出现不自主的发声或秽语，实验室检查可协诊，对抗风湿几激素治疗有效。
第二节亨廷顿舞蹈病
亨廷顿舞蹈病是基地神经节和大脑皮质变性的一种长染色体显形遗传病，其致病基因定位与4p16.3。患儿常发生在有舞蹈病的家族中，表现出进行性脑的舞蹈动作，并逐渐发展为手足徐动、僵直、供给失调。50%的患儿可有惊厥发生。脑CT检查因尾状核严重畏缩而显示脑室扩大。病情成进行性恶化，预后较差。
第三节肝豆状核变性
肝豆状核变性可有肌群不自主抽动和异常发声，二者需加以鉴别，肝豆状核变性由称威尔逊病，是由于铜代谢障碍所致的常染色体隐性遗传病，发病机制为大量的铜沉积在肝、脑、肾、角膜等，由此引起多样化的临床表现。起病隐匿缓慢，十岁以下起病者以肝脏损害为首发。神经症状主要表现为锥体外表现，舞蹈样动作，精细动作困难，用裂隙灯检查角膜可在角膜边缘看到有铜沉积于角膜后弹力层所形成的色素环，呈棕灰、棕绿色；宽约1~3毫米，称K-F环，在7岁以后才可见到。CT检查可见尾状核和豆状核见到低密度病灶。实验室检查有肝功能受损，血清铜蓝蛋白减低，尿排铜增加。
第四节癫痫
主要与部分运动性发作和肌阵挛性发作相鉴别，其鉴别要点为：多发性抽动症有其发展规律，多从眨眼开始，呈波浪式进展，逐渐发展颈、肩、四肢及全身。而癫痫发作的形式比较固定。且次数少。多发性抽动症的发作能用意志控制，而癫痫则不能。多发性抽动症的脑电图虽有异常，但多无特异性，而癫痫发作是有痫样放电，多发性抽动症的智力一般正常，而肌阵挛性发作智力一般低下。药物治疗的效果不同。
第五节沙眼
多发性抽动症的眨眼与沙眼相鉴别，沙眼是由于沙眼衣原体引起的慢性结膜炎，可表现为眼部的摩擦感或畏光，检查可见结膜充血，血管模糊、乳头增生、滤泡形成。
第六节咽炎
多发性抽动症表现的发声性抽动，如“吭吭”声，干咳声等需与咽炎相鉴别，多发性抽动症的发声有故意夸大的表现，检查咽部无异常。而咽炎的检查可见咽后壁充血，淋巴滤泡增生，有时可见痰样分泌物，急性期可发烧、咽痛。抗炎治疗有效。还需与注意缺陷多动障碍、感染后脑炎、手足徐动、苍白球黑质变性等鉴别。
多发性抽动症的治疗,像以前在治疗抽动症用的是西药，西药效果快，治标不治本，依赖性强，有时需要终生用药，一停药会反弹，长期用药对身体内脏都有严重危害。特别是对肾脏有极大的损害。
咱们北京仁爱堂的大夫治疗多动症用的是，镇静安神汤汤疗法。是在治疗抽动症和多动症多年的经验上研发生成的，可以有效治疗抽动问题。
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